Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
UBE2E1P51965 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.9 ms