Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
DAP3P51398 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DAP3P51398 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DAP3P51398 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DAP3P51398 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DAP3P51398 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DAP3P51398 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DAP3P51398 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DAP3P51398 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms