Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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RAB5CP51148 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB5CP51148 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB5CP51148 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RAB5CP51148 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RAB5CP51148 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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