Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MRE11P49959 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MRE11P49959 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MRE11P49959 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MRE11P49959 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MRE11P49959 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms