Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TAF6P49848 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TAF6P49848 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TAF6P49848 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TAF6P49848 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TAF6P49848 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms