Protein–RNA interactions for Protein: P49639

HOXA1, Homeobox protein Hox-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA1P49639 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXA1P49639 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms