Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TTPAP49638 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TTPAP49638 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TTPAP49638 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TTPAP49638 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TTPAP49638 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTPAP49638 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTPAP49638 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTPAP49638 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTPAP49638 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTPAP49638 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTPAP49638 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTPAP49638 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TTPAP49638 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TTPAP49638 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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