Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TUFMP49411 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TUFMP49411 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TUFMP49411 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFMP49411 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFMP49411 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFMP49411 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFMP49411 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFMP49411 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFMP49411 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFMP49411 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFMP49411 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TUFMP49411 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms