Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
POU3F4P49335 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POU3F4P49335 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.3 ms