Protein–RNA interactions for Protein: P49189

ALDH9A1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH9A1P49189 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ALDH9A1P49189 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ALDH9A1P49189 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms