Protein–RNA interactions for Protein: P47869

GABRA2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA2P47869 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
GABRA2P47869 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
GABRA2P47869 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms