Protein–RNA interactions for Protein: P43351

RAD52, DNA repair protein RAD52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD52P43351 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD52P43351 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD52P43351 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD52P43351 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD52P43351 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD52P43351 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD52P43351 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
RAD52P43351 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
RAD52P43351 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
RAD52P43351 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
RAD52P43351 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms