Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ETV4P43268 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
ETV4P43268 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ETV4P43268 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ETV4P43268 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ETV4P43268 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms