Protein–RNA interactions for Protein: P42574

CASP3, Caspase-3, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP3P42574 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CASP3P42574 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CASP3P42574 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CASP3P42574 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms