Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
ARL1P40616 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
ARL1P40616 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
ARL1P40616 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms