Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
ITGAEP38570 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
ITGAEP38570 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms