Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
POLR2IP36954 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
POLR2IP36954 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms