Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CHRNA7P36544 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CHRNA7P36544 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms