Protein–RNA interactions for Protein: P32242

OTX1, Homeobox protein OTX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX1P32242 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
OTX1P32242 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTX1P32242 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTX1P32242 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTX1P32242 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTX1P32242 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTX1P32242 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
OTX1P32242 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
OTX1P32242 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
OTX1P32242 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms