Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
TSPOP30536 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
TSPOP30536 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
TSPOP30536 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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