Protein–RNA interactions for Protein: P29965

CD40LG, CD40 ligand, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD40LGP29965 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CD40LGP29965 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms