Protein–RNA interactions for Protein: P29374

ARID4A, AT-rich interactive domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID4AP29374 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ARID4AP29374 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms