Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
GJB2P29033 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GJB2P29033 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GJB2P29033 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB2P29033 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB2P29033 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
GJB2P29033 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GJB2P29033 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms