Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PEX2P28328 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PEX2P28328 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PEX2P28328 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms