Protein–RNA interactions for Protein: P26951

IL3RA, Interleukin-3 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3RAP26951 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IL3RAP26951 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms