Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTX3P26022 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTX3P26022 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTX3P26022 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTX3P26022 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms