Protein–RNA interactions for Protein: P26006

ITGA3, Integrin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3P26006 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ITGA3P26006 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms