Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LMO1P25800 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LMO1P25800 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMO1P25800 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMO1P25800 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms