Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PSMA4P25789 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PSMA4P25789 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms