Protein–RNA interactions for Protein: P24821

TNC, Tenascin, humanhuman

Predictions only

Length 2,201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNCP24821 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNCP24821 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TNCP24821 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TNCP24821 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TNCP24821 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNCP24821 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNCP24821 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNCP24821 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TNCP24821 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms