Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
VAMP1P23763 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms