Protein–RNA interactions for Protein: P21860

ERBB3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERBB3P21860 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ERBB3P21860 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ERBB3P21860 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms