Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
AMY2BP19961 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms