Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TFE3P19532 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
TFE3P19532 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TFE3P19532 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TFE3P19532 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TFE3P19532 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFE3P19532 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFE3P19532 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TFE3P19532 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms