Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TNNI3P19429 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TNNI3P19429 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms