Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD53P19397 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD53P19397 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD53P19397 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
CD53P19397 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
CD53P19397 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
CD53P19397 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms