Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A2P16615 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ATP2A2P16615 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms