Protein–RNA interactions for Protein: P13866

SLC5A1, Sodium/glucose cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A1P13866 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SLC5A1P13866 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SLC5A1P13866 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms