Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
NEFHP12036 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
NEFHP12036 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
NEFHP12036 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
NEFHP12036 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms