Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CD8BP10966 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CD8BP10966 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8BP10966 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8BP10966 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8BP10966 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8BP10966 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8BP10966 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8BP10966 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CD8BP10966 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms