Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
MCF2P10911 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MCF2P10911 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MCF2P10911 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MCF2P10911 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MCF2P10911 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MCF2P10911 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MCF2P10911 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
MCF2P10911 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MCF2P10911 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MCF2P10911 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
MCF2P10911 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
MCF2P10911 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
MCF2P10911 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms