Protein–RNA interactions for Protein: P0DP58

LYNX1, Ly-6/neurotoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYNX1P0DP58 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LYNX1P0DP58 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms