Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
IGHV1-8P0DP01 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
IGHV1-8P0DP01 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms