Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
RGPD2P0DJD1 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
RGPD2P0DJD1 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms