Protein–RNA interactions for Protein: P0C866

LINC00869, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00869, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00869P0C866 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00869P0C866 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms