Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
FAM58BPP0C7Q3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms