Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

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Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PTPRCP08575 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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