Protein–RNA interactions for Protein: P08254

MMP3, Stromelysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP3P08254 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
MMP3P08254 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MMP3P08254 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MMP3P08254 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
MMP3P08254 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MMP3P08254 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MMP3P08254 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MMP3P08254 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
MMP3P08254 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MMP3P08254 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MMP3P08254 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms