Protein–RNA interactions for Protein: O95696

BRD1, Bromodomain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD1O95696 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD1O95696 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD1O95696 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD1O95696 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD1O95696 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD1O95696 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
BRD1O95696 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
BRD1O95696 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
BRD1O95696 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
BRD1O95696 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
BRD1O95696 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
BRD1O95696 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms