Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
POLR1AO95602 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
POLR1AO95602 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms